สารประกอบนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติเฉพาะ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการนำเสนอกรดอะมิโน D-Phe(3-CF3) ที่มีกลุ่ม trifluoromethyl มันมีคุณค่าอย่างยิ่งในเคมียารักษาและการพัฒนายา ซึ่งช่วยในการนำกลุ่ม trifluoromethyl เข้าสู่โครงสร้างเปปไทด์ เพิ่มความเสถียรและกิจกรรมทางชีวภาพ กลุ่มปกป้อง Boc (tert-butoxycarbonyl) รับประกันปฏิกิริยาที่เลือกสรรระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ ทำให้เป็นสารเคมีที่สำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ที่มุ่งเป้าไปยังโรคต่างๆ รวมถึงมะเร็งและความผิดปกติทางเมแทบอลิซึม เนื่องจากความสามารถในการปรับปรุงประสิทธิภาพยาและเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบระหว่างเปปไทด์-โปรตีนและกลไกเอนไซม์