สารนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โครงสร้างประกอบด้วยกลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ซึ่งทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่อะมีนหลักในระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตายตัว กลุ่ม allyloxycarbonyl (Alloc) ป้องกันหมู่อะมีนของสายข้าง ทำให้สามารถกำจัดกลุ่มป้องกันอย่างเลือกเฉพาะโดยไม่กระทบต่อกลุ่ม Fmoc กลยุทธ์การป้องกันสองชั้นนี้ช่วยให้ควบคุมการประกอบเปปไทด์ที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ สารนี้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์ยาที่มีฐานเปปไทด์ วัสดุชีวภาพ และเครื่องมือวิจัย โดยที่การกำจัดกลุ่มป้องกันอย่างเลือกเฉพาะและความบริสุทธิ์สูงเป็นสิ่งสำคัญ การประยุกต์ใช้สารนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในการพัฒนาเปปไทด์บำบัดและสารยึดเปปไทด์