Boc-Cys(Dpm)-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันไทออล (thiol) ของซีสเตอีน (cysteine) ในระหว่างการสังเคราะห์ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับหมู่อะมิโน ในขณะที่กลุ่ม Dpm (diphenylmethyl) ปกป้องกลุ่มไทออล ทำให้สามารถควบคุมการเกิดพันธะไดซัลไฟด์ (disulfide bond) ได้อย่างแม่นยำ สารเคมีนี้มีความสำคัญในอุตสาหกรรมยาและชีวเคมี ใช้ในการผลิตเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อนและมีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาเปปไทด์และวัคซีน นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีของโปรตีนและเอนไซม์ เพื่อทำความเข้าใจกลไกการทำงานของโมเลกุลเหล่านี้ในระบบชีวภาพ