Fmoc-D-Asp-OMe ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการสร้างสายเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ เนื่องจากกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ที่ติดอยู่สามารถป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดอะมิโนในช่วงการสังเคราะห์ และสามารถกำจัดออกได้ง่ายโดยใช้เบส เช่น ไพเปอรีดีน ทำให้กระบวนการสังเคราะห์มีความแม่นยำและควบคุมได้ดี สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีสารอะมิโนกรดแอสพาร์ติกในรูปแบบ D-configuration ซึ่งจำเป็นสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมของเปปไทด์และการพัฒนายาเพปไทด์ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการผลิต peptidomimetics และ bioactive peptides สำหรับงานวิจัยเภสัชกรรมและการค้นพบยา ความเสถียรและความเข้ากันได้กับโปรโตคอลการสังเคราะห์เปปไทด์มาตรฐานทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้สำหรับนักวิจัยในสาขานี้