สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์เปปไทด์และการวิจัยทางเภสัชวิทยา โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตเปปไทด์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งเปปไทด์ที่มีหน่วย tryptophan เนื่องจากมีโครงสร้าง indole กลุ่มปกป้อง tert-butoxycarbonyl (Boc) ช่วยให้สามารถกำจัดปกป้องได้อย่างเลือกสรรในการสังเคราะห์ ซึ่งช่วยให้ควบคุมการประกอบโซ่เปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ การนำไปใช้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาเปปไทด์บำบัด รวมถึงเปปไทด์ที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมของเปปไทด์ ซึ่งช่วยในการออกแบบยาที่มีประสิทธิภาพและเสถียรยิ่งขึ้น