สารประกอบนี้ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์และโมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยกลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ช่วยปกป้องหมู่ฟังก์ชันอะมิโนระหว่างปฏิกิริยาเคมี การป้องกันนี้มีความสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการผลิตยาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนากลาง chiral สำหรับการค้นพบยา ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างสารที่มีความบริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ได้ รูปแบบ hydrochloride ช่วยเพิ่มความละลาย ทำให้จัดการได้ง่ายในตัวทำละลายอินทรีย์ต่างๆ ระหว่างขั้นตอนในห้องปฏิบัติการ