สารประกอบนี้เป็นสารกลางเคมีพิเศษที่ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับยา สารชีวภาพที่มีฤทธิ์ และการสังเคราะห์เปปไทด์ ในฐานะเอสเตอร์เมทิลของ β-อะลานีนที่ป้องกันด้วย Boc มันให้กลุ่มเอมีนที่ป้องกัน (tert-butoxycarbonyl, Boc) ซึ่งปกป้องเอมีนระหว่างปฏิกิริยา ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบสำคัญสำหรับการนำหน่วย β-อะลานีนเข้าไปในเปปไทด์และโครงสร้างอื่น ๆ ยังใช้ในการพัฒนาโปรดรักและการผลิตเคมีภัณฑ์ละเอียด โดยกลุ่มเอสเตอร์และเอมีนที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยปรับโครงสร้างเพื่อเพิ่มความเสถียร ความละลาย หรือประสิทธิภาพทางชีวภาพ นิยมใช้ในงานวิจัยเคมียารักษาโรคสำหรับสังเคราะห์โมเลกุลซับซ้อนที่มีศักยภาพบำบัด