ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตเปปไทด์และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการเตรียมอนุพันธ์ซิสเตอีน ซึ่งจำเป็นในเภสัชกรรมและการวิจัยทางชีวเคมี สารนี้ยังถูกใช้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์และสารต้านอนุมูลอิสระเนื่องจากมีกลุ่มไทออลที่ทำปฏิกิริยาได้ นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการศึกษาคุณสมบัติโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน โดยเฉพาะกระบวนการสร้างและการลดพันธะดิสัลไฟด์ รูปแบบไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลาย ทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาที่ใช้ในน้ำ