N-Boc-3-iodo-DL-phenylalanine ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น กลุ่มเอมีโนที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกที่ได้ที่ตำแหน่งฟังก์ชันอื่นๆ ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์เปปไทด์และการพัฒนายา หมู่ไอโอดีนบนวงแหวนฟีนิลให้ตำแหน่งปฏิกิริยาสำหรับปฏิกิริยาครอส-คัพปลิง เช่น Suzuki หรือ Sonogashira couplings ซึ่งช่วยให้สามารถนำเข้าแทนที่ที่หลากหลาย สารประกอบนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะในเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบและสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพ รวมถึงตัวยับยั้งเอนไซม์และตัวปรับตัวรับ นอกจากนี้ ยังใช้เป็นบล็อกก่อสร้างในการศึกษาอนุพันธ์กรดอะมิโนและบทบาทของพวกมันในระบบชีวภาพ