ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างไซโคลบิวเทนในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น ยับยั้งเอนไซม์หรือรีเซพเตอร์เฉพาะชนิด โครงสร้างไซโคลบิวเทนที่มีหมู่ฟังก์ชันแอมป์และเอสเทอร์ช่วยเพิ่มเสถียรภาพและควบคุมรูปร่างของโมเลกุล ทำให้เหมาะสมสำหรับการออกแบบยาที่ต้องการการจับกับโปรตีนอย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารตัวกลางที่มีความซับซ้อนในขั้นตอนการสังเคราะห์แบบหลายขั้นตอน