ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นตัวประกอบย่อยที่ได้รับการป้องกัน ช่วยให้สามารถทำการจับคู่หมู่อะมีนแบบเลือกสรรได้ ในขณะที่ป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ หมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ให้การป้องกันที่สามารถละลายในกรด อนุญาตให้ถอดการป้องกันได้อย่างควบคุมภายใต้สภาวะกรดอ่อน ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์แบบเฟสแข็งและเฟสละลายของเปปไทด์ซับซ้อนและเปปไทด์เลียนแบบสำหรับการวิจัยเภสัชกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ รวมถึงอนุพันธ์ฮอร์โมนและตัวยับยั้งเอนไซม์ เนื่องจากความเสถียรและความเข้ากันได้กับตัวเชื่อมมาตรฐาน