ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายา เนื่องจากกลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นตัวป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยควบคุมการเกิดพันธะเปปไทด์ได้อย่างมีเลือกเฟ้น และสามารถกำจัดออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสมกับการสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน นอกจากนี้ สารนี้ยังใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างไซโคลเฮกซิลอะลานีน ซึ่งมีความสำคัญในด้านชีวเคมีและเภสัชกรรม