ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์ไลซีนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งช่วยให้สามารถดัดแปลงโปรตีนอย่างเลือกสรรและการไบโอคอนจูเกชันได้ กลุ่มนิโคตินอยล์ให้ตัวจับที่ละลายได้ด้วยแสง (photolabile) หรือละลายได้ทางเคมี (chemically labile) สำหรับการปล่อยที่ควบคุมได้ ใช้กันทั่วไปในระบบการส่งยา โดยเฉพาะในการออกแบบโปรดรักและการบำบัดแบบเจาะจงเป้าหมายที่ต้องการการกระตุ้นด้วยแสง นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาแซนวิชเอ็นไซม์และโพรบทางชีวเคมีเนื่องจากโครงสร้างคล้ายนิโคตินาไมด์ ซึ่งสนับสนุนการศึกษากิจกรรมของเอ็นไซม์เดอะอะซิติเลส กลยุทธ์การป้องกันแบบออร์โธกอนัลช่วยสนับสนุนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (solid-phase peptide synthesis) ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลชีวภาพที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำ