ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอินเทอร์มีเดียตที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะในการเตรียมเปปไทด์คล้ายคอลลาเจนและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ที่มี hydroxyproline. หมู่ Boc ให้การป้องกันชั่วคราวของหมู่อะมิโน ในขณะที่เอทิลเอสเทอร์ปกปิดกรดคาร์บอกซิลิก ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่แบบเลือกสรร. ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์หลายขั้นตอนของเปปไทด์ซับซ้อน. ใช้กันทั่วไปในการวิจัยเภสัชกรรมสำหรับพัฒนายับยั้งโปรติเอสและโครงสร้างรองรับสำหรับวิศวกรรมเนื้อเยื่อ.