ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะบล็อกสร้างกรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน หมู่ Boc ปกป้องหมู่อะมิโน ในขณะที่หมู่เบนซิล (Bzl) ปกป้องหมู่ไฮดรอกซิลของไซด์เชนโฮโมเซรีน สิ่งนี้ช่วยให้สามารถคัปปลิ้งแบบเลือกสรรที่กรดคาร์บอกซิลิกในระหว่างการประกอบเปปไทด์แบบเฟสแข็งหรือเฟสของเหลว หลังจากรวมเข้าในสายเปปไทด์ หมู่ Boc สามารถถูกกำจัดภายใต้สภาวะกรดอ่อนโดยไม่กระทบต่อการป้องกันเบนซิล หมู่เบนซิลถูกกำจัดในขั้นตอนเดปโพรเทคชันสุดท้าย โดยทั่วไปผ่านไฮโดรเจนโอลิซิสหรือกรดแรงเช่น HF เพื่อให้ได้หมู่ไฮดรอกซิลอิสระในเปปไทด์เป้าหมาย ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์เปปไทด์ชีวภาพที่ซับซ้อนซึ่งต้องการการป้องกันไซด์เชน