ใช้เป็นตัวกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการส่วนของกรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเพศในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการเตรียมเปปไทโดมิมิติกส์และผู้สมัครยาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง กลุ่มอะมีนที่ได้รับการป้องกันด้วย Boc ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันได้อย่างควบคุมภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็งและแบบสารละลาย นอกจากนี้ กลุ่มคลอโรฟีนิลสามารถทำหน้าที่เป็นจุดยึดสำหรับปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงเพิ่มเติมหรือเป็นองค์ประกอบโครงสร้างเพื่อมีอิทธิพลต่อ bioavailability และความสัมพันธ์การจับในเคมียารักษา