ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่แบบเลือกสรร ขณะที่ป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ที่โซ่ข้างของกรดแอสพาร์ติก หมู่ Boc ปกป้องหมู่ alpha-amino และเอสเทอร์เมทิลปกปิดกรดคาร์บอกซิลิกของโซ่ข้าง ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันและยืดโซ่เปปไทด์ได้อย่างควบคุม ใช้กันทั่วไปในการเตรียมเปปไทด์ซับซ้อนและเปปไทด์มิมิติกสำหรับการวิจัยเภสัชกรรม เหมาะสำหรับการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งและแบบสารละลาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อต้องการความสมบูรณ์ทางสเตอริโอเคมีของ D-กรดแอสพาร์ติก