ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์เป็นสารกลางที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะในการเตรียมเปปไทด์ที่ถูกดัดแปลงและเปปไทด์มิมิติกส์ (peptidomimetics) สาร Boc-protected homoserine lactone มีคุณค่าต่อการนำ homoserine หรืออนุพันธ์ของมันไปใช้ในตำแหน่งเฉพาะในโซ่เปปไทด์ โครงสร้างแลคโตนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเปิดวงแบบเลือกสรร (selective ring-opening) ซึ่งช่วยในการนำกรดอะมิโนที่มีการฟังก์ชันนาลิซ์ที่สายข้าง (side-chain functionalized amino acids) เข้ามา นิยมใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น ตัวยับยั้งเอนไซม์ (enzyme inhibitors) และเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์ (antimicrobial peptides) นอกจากนี้ยังใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอนแข็ง (solid-phase peptide synthesis) เนื่องจากมีความเสถียรและเข้ากันได้กับเงื่อนไขการคัปปลิ้งและการถอดป้องกันมาตรฐาน