ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์และโปรตีน โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่มีความเฉพาะเจาะจง โดยหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งที่ต้องการ และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสมกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียวในสารชีวโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาที่มีโครงสร้างเปปไทด์เป็นหลัก