H-Ser(tBu)-OtBu.HCl เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนในกระบวนการทางเคมีชีวภาพ โดยเฉพาะในการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดอะมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ สารนี้ช่วยให้สามารถควบคุมและเลือกปฏิบัติต่อกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะได้อย่างแม่นยำ ซึ่งเป็นประโยชน์ในการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาเพื่อศึกษากลไกการทำงานของโปรตีนและเปปไทด์ในร่างกาย อีกทั้งยังมีบทบาทสำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมสำหรับการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง