FmocNH-PEG4-t-butyl acetate ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับกรดอะมิโน เพื่อให้มั่นใจในการเกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรระหว่างการก่อตัวของพันธะเปปไทด์ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) เนื่องจากให้ความเสถียรและป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ กลุ่ม Fmoc สามารถถูกกำจัดออกได้อย่างง่ายดายภายใต้สภาวะเบสอ่อน ซึ่งช่วยให้สามารถก่อสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนแบบ stepwise ได้ ช่องว่าง PEG4 ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและความยืดหยุ่น ส่งเสริมการโต้ตอบที่ดีขึ้นกับตัวทำปฏิกิริยาและปรับปรุงประสิทธิภาพการสังเคราะห์ ส่วนของ t-butyl acetate ให้การป้องกันเพิ่มเติมสำหรับกลุ่มคาร์บอกซิล เพื่อควบคุมกระบวนการเคมีอย่างแม่นยำ สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้อย่างกว้างขวางในการพัฒนายา เปปไทด์ชีวภาพ และการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับวิศวกรรมโปรตีน