Fmoc-Cys(Acm)-OH ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) มันทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์ซีสเตอีนที่ได้รับการป้องกัน โดยที่กลุ่ม Fmoc ปกป้องหมู่อะมิโน และกลุ่ม Acm (อะซีตามิโดเมทิล) ปกป้องห่วงโซ่ข้างไทออลของซีสเตอีน การป้องกันนี้มีความสำคัญเพื่อป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ระหว่างการประกอบห่วงโซ่เปปไทด์ หลังจากการสังเคราะห์เปปไทด์เสร็จสิ้น กลุ่ม Acm สามารถถูกนำออกอย่างเลือกสรรภายใต้สภาวะอ่อนโยน อนุญาตให้เกิดการสร้างพันธะไดซัลไฟด์ ซึ่งจำเป็นสำหรับการพับตัวที่ถูกต้องและการทำงานของเปปไทด์และโปรตีนจำนวนมาก สารเคมีนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนซึ่งต้องการการสร้างพันธะไดซัลไฟด์ที่แม่นยำ เช่น ฮอร์โมน เอนไซม์ และเปปไทด์บำบัด ความเสถียรและความเข้ากันได้กับโปรโตคอล SPPS มาตรฐานทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในเคมีเปปไทด์