Fmoc-D-Thr(tBu)-OH ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์แบบโซลิดเฟส (Solid-phase peptide synthesis: SPPS) เนื่องจากกลุ่มป้องกัน Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ช่วยให้สามารถควบคุมและกำจัดกลุ่มป้องกันได้อย่างมีประสิทธิภาพในขั้นตอนต่างๆ ของการสังเคราะห์ นอกจากนี้ กลุ่ม tBu (tert-butyl) ที่ป้องกันหมู่ไฮดรอกซิลของทรีโอนีนยังช่วยเพิ่มความเสถียรของโมเลกุลในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ สารเคมีนี้มักถูกใช้ในการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อนหรือเปปไทด์ที่มีกรดอะมิโน D-form ซึ่งมีความสำคัญในการวิจัยทางเภสัชวิทยาและชีววิทยาโมเลกุล เนื่องจากสามารถนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีความจำเพาะสูง