Fmoc-Dap(Mtt)-OH ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) การประยุกต์ใช้หลักคือเป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับนำกรดอะมิโน diaminopropionic acid (Dap) เข้าสู่โซ่เปปไทด์ กลุ่ม Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ปกป้องกลุ่มอะมิโนหลักระหว่างการสังเคราะห์ ในขณะที่กลุ่ม Mtt (4-methyltrityl) ให้การป้องกันแบบเลือกสรรสำหรับกลุ่มอะมีนข้างของ Dap สิ่งนี้ช่วยให้ควบคุมการนำ Dap เข้าสู่เปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ โดยเฉพาะในกรณีที่ต้องการการถอดป้องกันแบบเลือกสรรสำหรับการดัดแปลงเพิ่มเติม สารนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อน เช่น ที่ใช้ในการพัฒนายา ซึ่งต้องการนำเข้าหรือป้องกันกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะ ความเสถียรภายใต้เงื่อนไข SPPS มาตรฐานและความสามารถในการถอดกลุ่ม Mtt แบบเลือกสรรทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในเคมีเปปไทด์