Boc-L-กรดกลูตามิก 5-เอสเตอร์ไซโคลเฮกซิล ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มป้องกันสำหรับกลุ่มคาร์บอกซิลของกรดกลูตามิก กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ปกป้องฟังก์ชันอะมิโน ในขณะที่เอสเตอร์ไซโคลเฮกซิลป้องกันเฉพาะกลุ่มคาร์บอกซิลของสายข้าง ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกที่ได้ที่ตำแหน่งอื่นๆ ระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน ซึ่งการควบคุมความแม่นยำเหนือ reactivity ของกลุ่มฟังก์ชันเป็นสิ่งจำเป็น นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาอินเตอร์มีเดียตเภสัชกรรม ช่วยให้สร้างเปปไทด์ชีวภาพที่มีคุณสมบัติโครงสร้างและฟังก์ชันเฉพาะ นอกจากนี้ยังพบการใช้งานในการเตรียมกรดอะมิโนที่ดัดแปลงสำหรับการวิจัยในชีวเคมีและเคมียารักษา