Z-Gln-ONp ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะสารป้องกันสำหรับกลูตามีน ซึ่งช่วยป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ระหว่างการสร้างพันธะเปปไทด์ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตายแข็ง (SPPS) โดยช่วยให้สามารถถอดสารป้องกันและกระตุ้นกรดอะมิโนเฉพาะได้อย่างเลือกสรร การนำไปใช้ช่วยให้ได้ผลผลิตและความบริสุทธิ์ของเปปไทด์ที่สังเคราะห์สูงขึ้น ทำให้จำเป็นสำหรับการผลิตเปปไทด์ซับซ้อนสำหรับงานวิจัยและการพัฒนายา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาทางเอนไซม์เพื่อตรวจสอบกิจกรรมและความจำเพาะของโปรติเอสและเอนไซม์อื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับการประมวลผลเปปไทด์