S-Benzyl-L-cysteinol ถูกนำไปใช้หลักๆ ในสาขาการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบสำคัญในการสร้างโซ่เปปไทด์ที่ซับซ้อน โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นกลุ่มปกป้องสำหรับฟังก์ชันไทออลในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้กลุ่มไทออลคงสภาพเดิมจนกว่าจะถึงขั้นตอนการกำจัดกลุ่มปกป้องขั้นสุดท้าย สิ่งนี้ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตเปปไทด์ที่มีซิสเทอีน ซึ่งจำเป็นสำหรับการประยุกต์ใช้ทางชีววิทยาและเภสัชกรรมต่างๆ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ที่ต้องการการควบคุมปฏิกิริยาไทออลอย่างแม่นยำ บทบาทของมันในการอำนวยความสะดวกในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีโครงสร้างหลากหลายและมีความสำคัญทางการทำงานเน้นย้ำถึงความสำคัญในเคมียารักษาและการค้นพบยา