Boc-Cys(Fm)-OH ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มปกป้องสำหรับสารประกอบ cysteine กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ปกป้องกลุ่มอะมิโน ในขณะที่กลุ่ม Fm (fluorenylmethyl) ปกป้องฟังก์ชัน thiol ของ cysteine การปกป้องแบบคู่นี้ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ ป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ซึ่งขั้นตอนการถอดปกป้องและการจับคู่ที่ควบคุมได้เป็นสิ่งจำเป็น นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อน รวมถึงที่มีพันธะ disulfide ซึ่งสำคัญในเปปไทด์และโปรตีนชีวภาพ ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ ทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้สำหรับนักวิจัยในเคมีเปปไทด์