สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในรูปแบบที่ป้องกันของซิสเตอีน กลุ่ม fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับกลุ่มอะมิโน ในขณะที่กลุ่ม triphenylmethyl (Trt) ป้องกันความสามารถของ thiol ของซิสเตอีน การป้องกันสองชั้นนี้ช่วยให้สามารถคัดลอกการกำจัดป้องกันของกลุ่มอะมิโนได้ในระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์แบบ solid-phase ทำให้สามารถสร้างเปปไทด์ทีละขั้นตอนได้ มีค่ามากในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อนที่มีซิสเตอีนเข้ามาเกี่ยวข้อง โดยให้แน่ใจว่ากลุ่ม thiol ยังคงอยู่จนกว่าจะถึงขั้นตอนการกำจัดป้องกันสุดท้าย สารประกอบนี้จำเป็นในการผลิตเปปไทด์สำหรับการวิจัยเภสัชกรรม การพัฒนายา และการศึกษาทางชีวเคมี