Fmoc-D-Phe-OPfp ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะใน solid-phase peptide synthesis (SPPS) ในฐานะบล็อกก่อสร้าง กลุ่ม Fmoc ช่วยป้องกันกลุ่มเอมีน ในขณะที่เอสเตอร์ pentafluorophenyl (OPfp) สนับสนุนการเชื่อมต่อกับกรดอะมิโนอื่นๆ อย่างมีประสิทธิภาพ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการนำ D-phenylalanine เข้าสู่เปปไทด์ ซึ่งสำคัญสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีสเตอรีโอเคมีเฉพาะเจาะจงหรือความเสถียรที่เพิ่มขึ้น ใช้อย่างแพร่หลายในการพัฒนาเปปไทด์เพื่อการบำบัด การวิจัยยาเปปไทด์ และการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมของเปปไทด์ ความตอบสนองสูงและความเลือกเฉพาะทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในห้องปฏิบัติการเคมีอินทรีย์และเภสัชเคมี