สารเคมีนี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน การประยุกต์ใช้หลักคือในการผลิตเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐาน กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) และ tBu (tert-butyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน ป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่พึงประสงค์ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ซึ่งช่วยให้เกิดการสร้างพันธะเปปไทด์อย่างเลือกสรรและอนุญาตให้สร้างโซ่เปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งเป็นวิธีที่ใช้กันทั่วไปในการวิจัยเภสัชกรรมและการพัฒนายา ความเสถียรและความเข้ากันได้กับตัวทำละลายต่างๆ ทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้สำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีลำดับเฉพาะ ซึ่งมักใช้ในยารักษา การศึกษาทางชีวเคมี และเครื่องมือวินิจฉัย