สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยสำหรับการสร้างโซ่เปปไทด์ที่ใหญ่กว่า โดยเฉพาะในวิธีการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตาย (SPPS) กลุ่มเอสเตอร์เมทิลช่วยป้องกันหน้าที่กรดคาร์บอกซิลิก ในขณะที่เกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยให้มีความเสถียรและละลายน้ำได้ดีในระหว่างปฏิกิริยา มันถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในห้องปฏิบัติการวิจัยสำหรับการพัฒนาเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ยา และอนุพันธ์โปรตีน การประยุกต์ใช้นี้มีความสำคัญในการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและฤทธิ์กิจกรรมของเปปไทด์ รวมถึงการออกแบบตัวแทนบำบัดสำหรับโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคเมแทบอลิซึม และโรคติดเชื้อ