Fmoc-β-Ala-OH ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการสร้างเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ ตัวเคมีนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้าง (building block) ที่สำคัญในการเชื่อมต่อกรดอะมิโนและเปปไทด์เข้าด้วยกัน เนื่องจากกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ช่วยในการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันอลของกรดอะมิโนในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ และสามารถกำจัดออกได้ง่ายเมื่อต้องการ นอกจากนี้ Fmoc-β-Ala-OH ยังถูกนำไปใช้ในการปรับแต่งโมเลกุลทางชีวภาพ เช่น การสร้างสารประกอบที่มีความจำเพาะสูงสำหรับการวิจัยทางเภสัชวิทยาและชีววิทยาโมเลกุล เนื่องจากโครงสร้างของ β-Ala (β-alanine) ที่มีความยืดหยุ่นและสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการออกแบบและสังเคราะห์สารใหม่ที่มีคุณสมบัติตามต้องการ ในอุตสาหกรรมยา Fmoc-β-Ala-OH มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาเปปไทด์และโปรตีนเทียม ซึ่งอาจนำไปใช้ในการรักษาโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคติดเชื้อ และโรคทางระบบภูมิคุ้มกัน การใช้ Fmoc-β-Ala-OH ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความแม่นยำในการสังเคราะห์เปปไทด์ ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญในการผลิตยาชนิดใหม่ๆ