Fmoc-Asn(Trt)-OH ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (Solid-phase peptide synthesis: SPPS) สารนี้เป็นรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของอะมิโนกรดแอสพาราจีน โดยกลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ปกป้องกลุ่มเอมีโน และกลุ่ม Trt (trityl) ปกป้องอะไมด์ของสายข้าง กลยุทธ์การป้องกันนี้ช่วยให้สามารถคัดลอกการกำจัดสารป้องกันจากกลุ่มเอมีโนได้อย่างเลือกสรรระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ซึ่งช่วยให้สามารถเพิ่มอะมิโนกรดตามลำดับเพื่อสร้างเปปไทด์ การนำไปใช้มีบทบาทสำคัญในการผลิตเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อนสำหรับงานวิจัย ยา และเทคโนโลยีชีวภาพ สารนี้ช่วยให้มั่นใจในความบริสุทธิ์สูงและประสิทธิภาพในการประกอบโซ่เปปไทด์ ทำให้เป็นสารเคมีที่มีคุณค่าต่อการพัฒนาเปปไทด์บำบัด วัคซีน และตัวแทนวินิจฉัย