Fmoc-N-(1-Boc-4-piperidyl)glycine นิยมใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) เนื่องจากมีกลุ่มป้องกัน Fmoc และ Boc ที่ช่วยในการควบคุมขั้นตอนการสร้างพันธะเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ กลุ่ม Fmoc สามารถถูกกำจัดออกได้ง่ายด้วยเบส เช่น ไพเปอรีดีน ในขณะที่กลุ่ม Boc ต้องใช้กรด เช่น TFA เพื่อการกำจัด ทำให้สามารถสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในด้านการออกแบบโมเลกุลที่มีเป้าหมายเฉพาะเจาะจง เช่น ตัวรับในระบบประสาทหรือเอนไซม์