Fmoc-l-lys(boc)-ol เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างกว้างขวางในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในการสร้างเปปไทด์แบบทีละขั้นตอน สารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้าง (building block) ที่มีกลุ่มป้องกัน (protecting groups) คือ Fmoc และ Boc เพื่อป้องกันการเกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ กลุ่ม Fmoc จะถูกกำจัดออกได้ง่ายด้วยเบส เช่น ไพเพอรีดีน ขณะที่กลุ่ม Boc สามารถกำจัดออกได้ด้วยกรด Fmoc-l-lys(boc)-ol มักใช้ในการนำเข้าหลัก lysine เข้าไปในโครงสร้างเปปไทด์ ซึ่งเป็นกรดอะมิโนที่สำคัญในการออกแบบเปปไทด์เพื่อการวิจัยทางชีววิทยาและยา นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนและพัฒนายาเปปไทด์อีกด้วย