Fmoc-L-beta-Homovaline ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับกลุ่มอะมิโนในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างเปปไทด์แบบทีละขั้นตอน สารนี้มีคุณค่าในการผลิตเปปไทด์ที่กำหนดเองสำหรับการวิจัยและการประยุกต์ใช้ทางเภสัชกรรม โดยช่วยให้สามารถรวม beta-homovaline ซึ่งเป็นกรดอะมิโนที่ไม่เป็นธรรมชาติ เข้าไปในลำดับเปปไทด์ การใช้สารนี้ช่วยอำนวยความสะดวกในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมของเปปไทด์ การพัฒนายา 기반เปปไทด์ และการสำรวจวัสดุชีวภาพใหม่ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์ peptidomimetics ซึ่งเป็นสารประกอบที่เลียนแบบโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์ มักมีเสถียรภาพหรือ bioavailability ที่เพิ่มขึ้น