Fmoc-Phe(4-CN)-OH ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในเทคนิค Solid-Phase Peptide Synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นวิธีการที่นิยมในการสร้างสายเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพ กลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ในโครงสร้างทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่เอมีโน ช่วยให้สามารถควบคุมการเติมกรดอะมิโนได้อย่างแม่นยำในแต่ละขั้นตอน นอกจากนี้ หมู่ไซยาโน (4-CN) ที่ตำแหน่งพาราบนวงแหวนฟีนิลalanine ช่วยเพิ่มความหลากหลายทางเคมีของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ขึ้น ซึ่งอาจมีผลต่อการปรับปรุงคุณสมบัติทางชีวภาพหรือความเสถียรของเปปไทด์ สารนี้ยังถูกนำไปใช้ในการศึกษาวิจัยทางเภสัชวิทยาและชีวเคมี เพื่อพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษาโรค หรือเป็นเครื่องมือในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและเปปไทด์ ความสามารถในการปรับแต่งโครงสร้างของ Fmoc-Phe(4-CN)-OH ทำให้มันเป็นสารตั้งต้นที่มีประโยชน์ในหลายสาขาวิชา ทั้งการแพทย์และวิทยาศาสตร์วัสดุ