สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในวิธีการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) มันทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการปกป้อง โดยกลุ่ม Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มปกป้องชั่วคราวสำหรับหมู่เอมีนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ กลุ่ม pMeOBzl (para-methoxybenzyl) ปกป้องหมู่ thiol ของส่วนข้างของ penicillamine เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มี penicillamine ซึ่งมักถูกศึกษาเพื่อการประยุกต์ใช้ทางบำบัด รวมถึงการบำบัดด้วยการจับเชลATE และการรักษาการเป็นพิษจากโลหะหนัก นอกจากนี้ เปปไทด์ที่สังเคราะห์โดยใช้อนุพันธ์นี้อาจถูกสำรวจสำหรับบทบาทในการปรับการตอบสนองของภูมิคุ้มกันหรือเป็นส่วนประกอบในระบบส่งยา กลยุทธ์การปกป้องแบบออร์โธกอนัล (Fmoc สำหรับเอมีนและ pMeOBzl สำหรับ thiol) ช่วยให้สามารถถอดการปกป้องแบบเลือกสรรและการยืดห่วงโซ่เปปไทด์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ