สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมในการสร้างเปปไทด์แบบทีละขั้นตอน Fmoc-D-Phe(3-F)-OH เป็นอนุพันธ์ของฟีนิลอะลานีนที่ถูกดัดแปลงด้วยกลุ่มฟลูออโรและกลุ่มป้องกัน Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ซึ่งช่วยให้สามารถควบคุมการสังเคราะห์ได้อย่างแม่นยำ กลุ่ม Fmoc ช่วยป้องกันกลุ่มฟังก์ชันของกรดอะมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ และสามารถกำจัดออกได้ง่ายเมื่อต้องการ กลุ่มฟลูออโรที่ตำแหน่งที่ 3 ของวงแหวนฟีนิลอาจมีผลต่อปฏิสัมพันธ์ของเปปไทด์กับเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น เพิ่มความเสถียรหรือปรับปรุงการจับกับตัวรับ สารนี้จึงมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาและสารชีวโมเลกุลที่มีความจำเพาะสูง