Fmoc-(S)-3-Amino-5-hexenoic acid ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างเฉพาะทางหรือมีคุณสมบัติทางชีวภาพที่ต้องการ กลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ที่อยู่ในโครงสร้างช่วยในการป้องกันกลุ่มเอมีนระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้สามารถควบคุมขั้นตอนการสร้างเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ กลุ่ม hexenoic acid ที่มีพันธะคู่ยังสามารถใช้ในการปรับเปลี่ยนโครงสร้างทางเคมีเพิ่มเติม เช่น การทำปฏิกิริยาเคมีแบบคลิกเคมี (click chemistry) เพื่อเชื่อมต่อโมเลกุลอื่น ๆ เข้ากับเปปไทด์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ สารเคมีนี้จึงมีบทบาทสำคัญในงานวิจัยด้านเคมีชีวภาพและการพัฒนายา