สารนี้ใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยสำหรับสร้างเปปไทด์ที่กำหนดเอง มีคุณค่าอย่างยิ่งในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) เนื่องจากมีกลุ่มป้องกัน Fmoc ที่สามารถกำจัดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะอ่อนโยน สารนี้มักใช้ในการพัฒนาเปปไทด์ทางเภสัชกรรม เพื่อผลิตลำดับเฉพาะที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพ โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่ม 4-methyl-phenyl ช่วยเพิ่มความเสถียรและการโต้ตอบกับบริเวณ hydrophobic ในโปรตีน ทำให้มีประโยชน์ในการออกแบบเปปไทด์สำหรับการค้นพบยาและการวิจัยทางชีวเคมี นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างเอนไซม์และซับสเตรต รวมถึงการพัฒนายา therapeutic ที่ขึ้นอยู่กับเปปไทด์ กลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันที่สามารถกำจัดออกได้ง่ายในขั้นตอนการสังเคราะห์ ทำให้สามารถควบคุมลำดับของกรดอะมิโนได้อย่างแม่นยำ