สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) กลุ่ม Fmoc ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับฟังก์ชันอะมีน ช่วยให้สามารถกำจัดป้องกันอย่างเลือกสรรได้ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ การรวมเข้าไปในเปปไทด์ช่วยให้สามารถสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนด้วยลำดับเฉพาะ กลุ่มโบรโม-ฟีนิลในโครงสร้างให้จุดปฏิกิริยาสำหรับการปรับเปลี่ยนทางเคมีเพิ่มเติม เช่น ปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง ซึ่งมีประโยชน์ในการพัฒนายาเพปไทด์หรือวัสดุชีวภาพ สารเคมีนี้มีคุณค่าต่อการวิจัยเภสัชกรรมในการออกแบบยารักษาเปปไทด์ การศึกษาการโต้ตอบของโปรตีน และการพัฒนาระบบส่งยาแบบกำหนดเป้าหมาย การประยุกต์ใช้ยังเกี่ยวข้องกับสาขาการไบโอคอนจูเกชัน ซึ่งช่วยในการติดเปปไทด์กับโมเลกุลอื่นหรือพื้นผิวสำหรับวัตถุประสงค์วินิจฉัยหรือบำบัด