เคมีภัณฑ์นี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) มันทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยที่กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่ฟังก์ชันอะมิโน ส่วนของ 4-chloro-L-beta-homophenylalanine นำโครงสร้าง phenylalanine ที่ดัดแปลงแล้วมาใช้ในสายเปปไทด์ ซึ่งมีคุณค่ามากในการออกแบบเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติหรือหน้าที่เฉพาะ การรวมเข้าไปในเปปไทด์มักมีวัตถุประสงค์เพื่อเพิ่มความเสถียร เปลี่ยนแปลงความสัมพันธ์ในการจับ (binding affinity) หรือปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพ สารประกอบนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการวิจัยและพัฒนาเปปไทด์บำบัด โดยสำรวจการดัดแปลงโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพยาและความจำเพาะ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างเอนไซม์และซับสเตรต รวมถึงการวิศวกรรมโปรตีน ซึ่งต้องการลำดับกรดอะมิโนที่ปรับแต่งสำหรับวัตถุประสงค์ทางทดลองหรืออุตสาหกรรม