สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะหน่วยสร้าง (building block) สำหรับสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) เนื่องจากมีกลุ่มปกป้อง Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ซึ่งสามารถถูกกำจัดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อนๆ การมีอะตอมฟลูออรีนบนวงแหวนฟีนิลช่วยเพิ่มประโยชน์ในการออกแบบเปปไทด์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะหรือความเสถียรที่ปรับปรุงแล้ว มักถูกนำมาใช้ในการวิจัยเภสัชภัณฑ์เพื่อพัฒนายา 기반เปปไทด์ โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปยังตัวรับหรือเอนไซม์ ซึ่งส่วน fluorophenyl สามารถมีอิทธิพลต่อความสัมพันธ์การจับ (binding affinity) หรือความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญ (key intermediate) ในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ดัดแปลงสำหรับการศึกษาทางชีวเคมีหรือโปรแกรมค้นพบยา