Fmoc-(S)-3-Amino-4-(4-fluoro-phenyl)-butyric acid ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะบล็อกก่อสร้าง กลุ่ม Fmoc ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับหมู่อะมีน ช่วยให้สามารถยืดโซ่เปปไทด์ได้อย่างควบคุมและต่อเนื่อง สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีสารตกค้างอะโรมาติกฟลูออรีน ซึ่งสามารถเพิ่มความเสถียร ความสัมพันธ์ในการจับ หรือกิจกรรมทางชีวภาพของเปปไทด์ที่ได้ สารนี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสร้างยาที่มีฐานเปปไทด์ ตัวยับยั้งเอนไซม์ และโพรบสำหรับการศึกษาทางชีวเคมี การรวมกลุ่มฟลูออโร-ฟีนิลยังสามารถปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ของเปปไทด์ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในการออกแบบยา