Fmoc-D-(2-thienyl)glycine ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (Solid-phase peptide synthesis: SPPS) มันทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยสำหรับนำกรดอะมิโนที่ไม่เป็นธรรมชาติเข้าไปในเปปไทด์ เพื่อเพิ่มความหลากหลายทางโครงสร้างและการทำงาน กลุ่ม Fmoc ช่วยให้สามารถกำจัดสารป้องกันได้อย่างเลือกสรรระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้ควบคุมกระบวนการประกอบเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ สารเคมีนี้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาเปปไทด์ สารเปปไทด์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ และเครื่องมือวิจัยสำหรับศึกษาการโต้ตอบและหน้าที่ของโปรตีน โครงสร้างข้าง thienyl ที่ไม่เหมือนใครสามารถมีอิทธิพลต่อการกำหนดรูปแบบของเปปไทด์และคุณสมบัติการจับ ทำให้มีประโยชน์ในการออกแบบเปปไทด์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะหรือความเสถียรที่ปรับปรุงแล้ว