สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน กลุ่มฟลูออเรนิลเมทอกซีคาร์บอนิล (Fmoc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับฟังก์ชันอะมิโน ซึ่งสามารถถอดออกได้อย่างเลือกสรรภายใต้สภาวะเบสอ่อน ช่วยให้การสร้างเปปไทด์แบบขั้นตอนได้ กลุ่ม o-tolyl ที่มีอยู่เพิ่มคุณสมบัติเชิง steric และอิเล็กทรอนิกส์ที่สามารถมีอิทธิพลต่อโครงสร้างและการทำงานของเปปไทด์ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งช่วยให้การประกอบสายเปปไทด์ที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ลักษณะ chiral ของมันทำให้มีประโยชน์ในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่บริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ ซึ่งสำคัญในงานวิจัยและพัฒนายา