N-Cbz-L-threonine benzyl ester ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของ threonine กลุ่ม Cbz (carbobenzoxy) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับฟังก์ชันอะมิโน ในขณะที่ benzyl ester ป้องกันกลุ่มคาร์บอกซิล การป้องกันแบบคู่นี้ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกเพศได้ในระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ซับซ้อน ทำให้สามารถนำ threonine residue เข้าไปได้อย่างแม่นยำโดยไม่เกิดปฏิกิริยาข้างเคียงที่ไม่ต้องการ มีคุณค่าอย่างยิ่งใน solid-phase peptide synthesis (SPPS) และ solution-phase peptide synthesis ซึ่งต้องการการควบคุมลำดับและโครงสร้างของเปปไทด์อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการเตรียมยาเพปไทด์ เปปไทด์ชีวภาพ และสารประกอบวิจัยที่ threonine มีบทบาทสำคัญในกิจกรรมทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย