Boc-Asp-OH ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารป้องกันสำหรับกลุ่มอะมิโนของกรดแอสปาร์ติก (Asp) ในกระบวนการสังเคราะห์ เพื่อให้สามารถควบคุมการเชื่อมต่อเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ โดยเฉพาะในวิธีสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตาย (SPPS) เพื่อป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ กลุ่ม Boc สามารถถูกกำจัดได้ง่ายภายใต้สภาวะกรด ซึ่งช่วยให้การยกเลิกการป้องกันและการปรับเปลี่ยนเปปไทด์ต่อไปเป็นไปอย่างควบคุม นอกจากนี้ ยังใช้ในกระบวนการสร้างโมเลกุลทางชีวภาพที่ซับซ้อน เช่น การสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพและวัสดุชีวภาพที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง